Die Zertifizierung der EHGS dauert im Normalfall zwischen sechs und zwölf Monaten. Der Schwerpunkt liegt hierbei auf der Zusammenstellung der erforderlichen Unterlagen, was in der Regel die meiste Zeit in Anspruch nimmt. Nach der Genehmigung und Prüfung des vollständigen Dossiers durch die Prüfungskommission wird eine Vor-Ort-Prüfung durchgeführt. Nach der gemeinsamen Auswertung des Audits erfolgt die abschliessende EHGS-Zertifizierung.
Die Zertifizierung von EHGS-Weiterbildungsstätten erfordert einen erheblichen Aufwand. Die Zertifizierung kann bis zu 24 Monate dauern, da die Kriterien streng sind und einen Stellenschlüssel von etwa 200 Stellenprozenten gefordert wird.